本文介绍: PackagepaleobioDBpaleobioDB 包在2020年已经停止更新,该包依赖PBDB v1 API。可以选择在下载安装包后,执行本地安装。
Package paleobioDB version 0.7.0
paleobioDB 包在2020年已经停止更新,该包依赖PBDB v1 API。
可以选择在Index of /src/contrib/Archive/paleobioDB (r-project.org)下载安装包后,执行本地安装。
Usage
pbdb_ref_occurrences (...)
Argument
参数【…】: 可通过 API 调用的参数。所有可用参数详见 PBDB Data Service: Bibliographic references for fossil occurrences。
Value
根据请求匹配结果返回的参考文献的基本信息,保存在一个数据帧中。
Example
library(paleobioDB)
library(RCurl)
options(RCurlOptions = list(cainfo = system.file("CurlSSL", "cacert.pem", package = "RCurl")))
pbdb_ref_occurrences (vocab="pbdb",
base_name="Canis", year=2000)
reference_no record_type ref_type author1init author1last
1:1 10946 reference occ A. Forsten
1:2 13150 reference occ M. Mazzini
1:3 2940 reference occ K. L. Rogers
2 67162 reference occ L. Werdelin
author2init author2last pubyr
1:1 S. Sharapov 2000
1:2 V. Borselli 2000
1:3 C. A. Repenning 2000
2 M. E. Lewis 2000
reftitle
1:1 Fossil equids (Mammalia, Equidae) from the Neogene and Pleistocene of Tadzhikistan
1:2 Poggiorosso: un importante arrichimento delle faune villafranchiane a vertebrati del Valdarno Superiore, di eta prossima al limite Plio-Pleistocene
1:3 Geologic history, stratigraphy, and paleontology of SAM Cave, north-central New Mexico
2 Carnivora from the South Turkwel Hominid Site, Northern Kenya
pubtitle pubvol pubno
1:1 Geodiversitas 22 2
1:2 Bollettino della Societa Paleontologica Italiana 39 3
1:3 New Mexico Geology 22 4
2 Journal of Paleontology 74 6
firstpage lastpage publication_type otherauthors
1:1 293 314 journal article <NA>
1:2 381 388 journal article E. Cioppi, G. Napoleone
1:3 89 117 journal article F. G. Luiszer, R. D. Benson
2 1173 1180 journal article <NA>
language
1:1 <NA>
1:2 Italian
1:3 English
2 English
Page
function (...)
{
l <- list(...)
.pbdb_query("occs/refs", query = l)
}
原文地址:https://blog.csdn.net/whitedrogen/article/details/135593852
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